一、地質(zhì)與地貌
三江源區(qū)是青藏高原的腹地和主體，以山地地貌為主，山脈綿延、地勢高聳、地形復(fù)雜，海拔為3335~6564m，最低海拔位于玉樹藏族自治州東南部的金沙江江面，平均海拔4400m左右。海拔4000~5800m的高山是保護(hù)區(qū)地貌的主要骨架。主要山脈為東昆侖山及其支脈阿尼瑪卿山、巴顏喀拉山和唐古拉山山脈。由于受第四紀(jì)冰期作用和現(xiàn)代冰川的影響，海拔5000m以上的山峰可見古冰川地貌。
保護(hù)區(qū)中西部和北部呈山原狀，起伏不大、切割不深、多寬闊而平坦的灘地，因地勢平緩、冰期較長、排水不暢，形成了大面積沼澤。東南部高山峽谷地帶，切割強(qiáng)烈，相對(duì)高差多在1000m以上，地形陡峭，坡度多在30°以上。
二、氣候
區(qū)內(nèi)氣候?qū)偾嗖馗咴瓪夂蛳到y(tǒng)，為典型的高原大陸性氣候，表現(xiàn)為冷熱兩季交替，干濕兩季分明，年溫差小，日溫差大，日照時(shí)間長，輻射強(qiáng)烈，無四季區(qū)分的氣候特征。冷季為青藏冷高壓控制，長達(dá)7個(gè)月，熱量低，降水少，風(fēng)沙大；暖季受西南季風(fēng)影響產(chǎn)生熱氣壓，水氣豐富，降水量多。由于海拔高，絕大部分地區(qū)空氣稀薄，植物生長期短。
全年平均氣溫為-5.6~3.8℃。其中最熱月7月平均氣溫為6.4—13.2℃，極端最高氣溫28℃；最冷月1月為-6.6~-13.8℃，極端最低氣溫-48℃。年平均降水量262.2~772.8mm，其中6—9月降水量約占全年降水量的75%，而夜雨量比例則達(dá)55%~66%。年蒸發(fā)量在730~1700mm之間。日照百分率為50~65%，年日照時(shí)數(shù)2300~2900小時(shí)，年輻射量5500~6800兆焦耳/平方米。沙暴日數(shù)一般19天左右，最多達(dá)40天(曲麻萊)。